处理公司拒不提供考勤记录的问题时，以下特殊情形可能影响处理结果：1、考勤记录因不可抗力灭失。若公司能证明考勤记录因火灾、水灾等不可抗力灭失且已尽合理保管义务，可能无需承担违法责任，但劳动者需通过其他证据维权，难度会增加。2、劳动者未按规定程序申请查阅。若公司有明确查阅考勤记录的内部程序，而劳动者未按程序申请，公司暂不提供的行为可能不被认定违法，劳动者需按规定重新申请。3、考勤记录涉及商业秘密。公司可对涉及商业秘密的部分合理处理，但不能以此为由完全拒提供与劳动者相关的考勤信息，需在保护商业秘密和劳动者知情权间平衡，否则仍可能违法。
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判断公司拒不提供考勤记录是否违法，可依据相关法律法规：《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第六条明确：“发生劳动争议，当事人对自己提出的主张，有责任提供证据。与争议事项有关的证据属于用人单位掌握管理的，用人单位应当提供；用人单位不提供的，应当承担不利后果。”考勤记录是用人单位掌握的劳动争议相关重要证据，劳动者因争议需考勤记录时，公司拒不提供即违反法律，应承担不利后果。
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判断公司拒不提供考勤记录是否违法，需结合具体情况：一般而言，公司拒不提供考勤记录是违法的。若劳动者因工资支付、加班工资、解除劳动合同等劳动争议需要考勤记录作为证据，公司拒不提供即违法。根据相关法律，考勤记录属于用人单位应建立保存的劳动用工资料，劳动者有权查阅、复制，公司不提供的应承担不利后果。
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公司拒不提供考勤记录可能给劳动者带来以下法律风险：1、加班工资无法主张的风险。若劳动者存在加班但公司拒不提供考勤记录，且劳动者无法提供其他有效证据证明加班事实，仲裁机构或法院可能难以支持其加班工资请求，例如劳动者主张每月休息日加班但无考勤记录佐证，可能无法获得支持。

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